V úvodu této části je třeba zdůraznit, že program SSB2000 neslouží jako program účetní, může však poskytovat podklady pro účetnictví. Program SSB2000 disponuje několika velmi silnými mechanizmy pro spolupráci s účetnictvím. Jedná se zejména o mechanismus účetního období, který slouží hlavně ke kontrole vstupů, a mechanismy hospodářských středisek a „účetních předkontací“, které umožňují vytvářet výstupy v potřebné struktuře.

Z výše uvedeného vyplývá, že před nastavením a vlastním provozem programu SSB2000 by měla proběhnout analýza, jaké podklady pro účetnictví je třeba z programu SSB2000 získávat a které podklady z účetnictví je naopak potřeba do SSB2000 pořizovat.

Důležitým účetním prvkem v programu SSB2000 je možnost zadání účetních předkontací. Pro každou jednotlivou složku předpisu lze zvlášť nastavit účetní předkontace „má dáti“ a „dal“ a to jak pro základ daně, tak pro daň. Nastavení je možno provést jednotlivě pro složky předpisu, hromadně při samotné definici složky předpisu nebo prostřednictvím mimořádných akcí úlohou Hromadné nastavení složek předpisu či Hromadná změna sazeb (růst nájemného). Řada sestav pak umožňuje vyčíslit předpisy vyměřené pod účetními předkontacemi. Jedná se zejména o sestavy sdružené v menu Sestavy ⇒ Statistiky. Typické využití předkontací je např. nastavení jiných předkontací pro složky předpisů pro byty a jiných pro složky předpisů pro nebytové prostory. Jiná možnost je pomocí předkontací rozdělit celkový měsíční předpis na nájemné za plochu, nájemné za zařizovací předměty a zálohy na služby (pokud nejsou předkontace použity, je k dispozici pouze sestava členěná po složkách a výsledná čísla pro zaúčtování je třeba pracně sčítat, což je, zvláště při větším počtu hospodářských středisek, nepříjemné).

V tom nejjednodušším pohledu na spolupráci programu SSB2000 a programu účetnictví je třeba zajistit aby oba programy vykazovali stejné ekonomické výsledky, tj. předpisy (pohledávky) a platby (úhrada pohledávek).

Prakticky bez výjimky platí, že SSB2000 je zdrojem předpisů pro účetnictví. Tyto předpisy lze do účetnictví dostat opisem z tiskových sestav v menu Sestavy ⇒ Statistiky (běžný postup) nebo převodem pomocí datových souborů (v případě větších správců a větších počtů hospodářských středisek, je třeba řešit individuálně dle konkrétních potřeb). Po odsouhlasení a zaúčtování je třeba v SSB2000 posunout účetní období předpisů, aby nemohla být změněna zaúčtovaná čísla v daném účetním období.

Větší variabilnost je v oblasti plateb za užívání bytu. Platby lze pořizovat souběžně do SSB2000 i účetnictví (v případě malých správ nebo při použití inkasa to není problém), platby pořizovat do účetnictví a pomocí datových souborů je převádět do SSB2000 (s použitím variabilních symbolů a úlohy Dávka plateb časté řešení) a konečně je možno platby pořizovat do SSB2000 a pomocí datových souborů je převádět do účetnictví. Po odsouhlasení a zaúčtování je třeba v SSB2000 posunout účetní období plateb, aby nemohla být změněna zaúčtovaná čísla v daném účetním období.

Poslední oblastí, kde je vhodné zajistit kontrolu s účetnictvím, jsou náklady pro vyúčtování služeb. Obvykle se náklady kontrolují v rámci roku, nikoliv měsíčně. Stejně jako u předpisů a plateb je třeba pracovat s účetním obdobím nákladů. Navíc je možno u jednotlivých nákladových položek zadávat položku „kód 1“. Tato položka je primárně určena ke kontrole nákladů zadaných podle kódu. Jestliže na faktuře za spotřebu elektrické energie jsou fakturovány spotřeba za elektroměr STA, elektroměr výtahu a elektroměr za chodbové osvětlení, náklady budou zadány do SSB2000 proti zálohám na složky předpisu STA, výtah a spol. osvětlení. V účetnictví je tato faktura evidována jako náklady na el. energii. Normálně lze kontrolovat náklady po jednotlivých složkách. V tomto případě je třeba použít položku kód 1 a u všech třech nákladových položek zadat její hodnotu např. „EL“. Při kontrole lze zobrazit všechny náklady s touto hodnotou a porovnat s účetní hodnotou nákladů na el. energii.